AT2G34520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mitochondrial ribosomal protein S14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
nuclear-encoded mitochondrial ribosomal protein S14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
mitochondrial ribosomal protein S14 (RPS14); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S14 (InterPro:IPR001209), Ribosomal protein S14, conserved site (InterPro:IPR018271); Has 6726 Blast hits to 6726 proteins in 2284 species: Archae - 0; Bacteria - 3988; Metazoa - 119; Fungi - 127; Plants - 631; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1861 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14548218..14548712 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18740.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 12.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 164 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLRRVLLN VTSYCQRSLT QSSYSTSGML SRSVVKHANN LGQIQARHFT TTLMKSGPKH SGTEQGVKRN SADHRRRLLA ARFELRRKLY KAFCKDPDLP 101: SEMRDKNRYK LSKLPRNSAF ARIRNRCVFT GRSRSVTELF RVSRIVFRGL ASKGALMGIT KSSW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)