AT2G34490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.557 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 710, subfamily A, polypeptide 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with C22-sterol desaturase activity. The enzyme was shown to catalyze the conversion of both 24-<i>epi</i>-campesterol and β-sitosterol to brassicasterol and stigmasterol, respectively, in the presence of NADPH. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 710, subfamily A, polypeptide 2 (CYP710A2); FUNCTIONS IN: C-22 sterol desaturase activity, oxygen binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 710, subfamily A, polypeptide 1 (TAIR:AT2G34500.1); Has 26372 Blast hits to 26256 proteins in 1476 species: Archae - 47; Bacteria - 2960; Metazoa - 10471; Fungi - 4624; Plants - 7423; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 847 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14535874..14537373 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56348.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 499 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVFSVSIFAS LAPYLVSALL LFFLIEQLSY LVKKRNLPGP LFVPPIIGNA ISLVRDPTSF WFKQSDTAGT SPGLAANYLI GKFIIYIRDT ELSHQIFSNV 101: RLEAFHPLGH PFGKQLFGDH SLIYLFGEDH KTVRRHLAPN FTPKALSTYS DLQQIVMLRH LRQWEESFSG GTKPVSMRDL VRELNLETSQ TVFVGPYLDK 201: EARNTFCTDY NLFNLGSMAL PINLPGFAFN KARRAVMNLE KTLSVCAGKS KKRMATGEEP TCLIDFWMHA FVTEIESGNP PPLHSEDEAI GGLLFDFLFA 301: AQDASTSSLL WAVTFLESHP KVLSKVREEV AKIWSPQSGH LITADQLAEM KYTRAVAREV VRYRPPATMV PHIATNDFPL TESYTIPKGT IVFPSVFDAS 401: FQGFTEPNRF DPDRFSETRQ EDQVFKRNYL AFGWGAHQCV GQRYALNHLV LFIAMFSSLF DFKRLQSDGC DDIIYCPTIS PKDGCTVFLS KRIVTYPNL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)