AT2G32800.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
AP4.3A; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein (TAIR:AT3G53810.1); Has 158212 Blast hits to 101795 proteins in 4184 species: Archae - 108; Bacteria - 18021; Metazoa - 52899; Fungi - 11286; Plants - 55530; Viruses - 412; Other Eukaryotes - 19956 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13916478..13919033 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 96091.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 851 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPMAMDHLC FVLPTESGEL KPPVMVEETT EEEEEKKSRD CGRQVVSLIG DLFRRLHGSK LVKSLNLCSI NESKDSISME INKSFTDMEG VQLSSKVGCE 101: NPRIFGYSEL YIGTNGFSDE LILGSGGFGR VYKALLPSDG TTVAVKCLAE KKGEQFEKTF AAELVAVAQL RHRNLVKLRG WCLHEDELLL VYDYMPNRSL 201: DRVLFRRPEV NSDFKPLDWD RRGKIVKGLA AALFYLHEQL ETQIIHRDVK TSNVMLDSEF NAKLGDFGLA RWLEHKIDET EHDSSYDSVS SFRNHQFRVA 301: DSTRIGGTIG YLPPESFRKK TVATAKTDVF SFGVVVLEVV SGRRAVDLSF SEDKIILLDW VRRLSDNRKL LDAGDSRLAK GSYDLSDMKR MIHLALLCSL 401: NNPTHRPNMK WVIGALSGEF SGNLPALPSF KSHPLYIPLS SLKSTSTSAT TTTTRTTMTT TTSTTSFNAS SESTPSSNYV TALEDSIYQT AETGENPYFN 501: YNSRRVMSSK SFVLDTPREI SYNDLVLATD NFSDARRVAE VDFGTAYYGL LNGDQHIVVK RLGMTKCPAL VTRFSTELLN LGRLRHRNLV MLRGWCTEHG 601: EMLVVYDYSA NRKLSHLLFH NHIPGNSVLR WKSRYNVIKS LACAVRYLHE EWDEQVIHRN ITSSTIFLDR DMNPRLCGFA LAEFLSRNDK AHQAAKKKGS 701: AQGIFGYMAP EYMESGEATT MADVYSFGVV VLEMVTGQPA VDYKRKKEDA LMVLRIREVV GNRKKLLEEI ADIHLDDEYE NRELARLLRL GLVCTRTDPK 801: LRPSISQVVS ILDGSERFFE EEGGKEGDVS RKQMYDSSML MIRQMQALGI H |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)