AT2G31955.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cofactor of nitrate reductase and xanthine dehydrogenase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
COFACTOR OF NITRATE REDUCTASE AND XANTHINE DEHYDROGENASE 2. Encodes a protein involved in molybdenum cofactor biosynthesis. Homologous to E.coli moaA. Expression is abundant in all tissues examined, particularly in roots. Appears to have targeting signals for chloroplast or mitochondria. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cofactor of nitrate reductase and xanthine dehydrogenase 2 (CNX2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Molybdenum cofactor synthesis C-terminal (InterPro:IPR010505), Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), Elongator protein 3/MiaB/NifB (InterPro:IPR006638), Molybdenum cofactor biosynthesis protein A (InterPro:IPR013483), Radical SAM (InterPro:IPR007197), MoaA/nifB/pqqE, iron-sulphur binding, conserved site (InterPro:IPR000385); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:13584635..13586484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43416.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 390 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRRCFSKITD CHLGFKNSNF LLVGSEVGSG SVTRTITTTT SERLFSSSYA AHQVDQIKDN PVSDMLIDKF GRLHTYLRIS LTERCNLRCQ YCMPSEGVEL 101: TPKPQLLSQS EIVRLAGLFV SAGVNKIRLT GGEPTVRKDI EEICLQLSSL KGLKNLAITT NGITLAKKLP RLKECGLDSL NISLDTLVPA KFEFLTRRKG 201: HDRVMKSIDT AIELGYNPVK VNCVIMRGLN DDEICDFVEL TRDKPINVRF IEFMPFDGNV WNVKKLVPYA EVMDKVVKRF PSIKRMQDHP TETAKNFTID 301: GHCGSVSFIT SMTEHFCAGC NRLRLLADGN FKVCLFGPSE VSLRDPLRSG ADDEALREII GAAVKRKKAA HAGMLDIAKT ANRPMIHIGG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)