AT2G31810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ACT domain-containing small subunit of acetolactate synthase protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ACT domain-containing small subunit of acetolactate synthase protein; FUNCTIONS IN: acetolactate synthase activity, amino acid binding; INVOLVED IN: branched chain family amino acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acetolactate synthase, small subunit (InterPro:IPR004789), Amino acid-binding ACT (InterPro:IPR002912), Acetolactate synthase, small subunit, C-terminal (InterPro:IPR019455); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: VALINE-TOLERANT 1 (TAIR:AT5G16290.2); Has 12099 Blast hits to 6187 proteins in 1994 species: Archae - 228; Bacteria - 7466; Metazoa - 4; Fungi - 262; Plants - 115; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4024 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13524271..13528246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53876.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 491 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAISVSSSP SIRCLRSACS DSSPALVSST RVSFPAKISY LSGISSHRGD EMGKRMEGFV RSVDGKISDA SFSEASSATP KSKVRKHTIS VFVGDESGMI 101: NRIAGVFARR GYNIESLAVG LNRDKALFTI VVCGTERVLQ QVIEQLQKLV NVLKVEDISS EPQVERELML VKVNAHPESR AEIMWLVDTF RARVVDIAEH 201: ALTIEVTGDP GKMIAVERNL KKFQIREIVR TGKIALRREK MGATAPFWRF SAASYPDLKE QAPVSVLRSS KKGAIVPQKE TSAGGDVYPV EPFFDPKVHR 301: ILDAHWGLLT DEDTSGLRSH TLSLLVNDIP GVLNIVTGVF ARRGYNIQSL AVGHAETKGI SRITTVIPAT DESVSKLVQQ LYKLVDVHEV HDLTHLPFSE 401: RELMLIKIAV NAAARRDVLD IASIFRAKAV DVSDHTITLQ LTGDLDKMVA LQRLLEPYGI CEVARTGRVA LARESGVDSK YLRGYSFPLT G |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)