AT2G30390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ferrochelatase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes one of two ferrochelatase genes in Arabidopsis. Ferrochelatase is the terminal enzyme of heme biosynthesis. FC-II is speculated to operate in photosynthetic cytochromes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ferrochelatase 2 (FC2); FUNCTIONS IN: ferrochelatase activity; INVOLVED IN: heme biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ferrochelatase, active site (InterPro:IPR019772), Ferrochelatase (InterPro:IPR001015); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ferrochelatase 1 (TAIR:AT5G26030.2); Has 7540 Blast hits to 7536 proteins in 2081 species: Archae - 19; Bacteria - 4228; Metazoa - 173; Fungi - 140; Plants - 125; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2855 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:12951242..12953985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56622.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 512 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNCPAMTASP SSSSSSSYST FRPPPPLLPQ LSNDSQRSVV MHCTRLPFEA FAATSSNRLL GKHSLPLRAA LVTSNPLNIS SSSVISDAIS SSSVITDDAK 101: IGVLLLNLGG PETLDDVQPF LFNLFADPDI IRLPPVFQFL QKPLAQFISV ARAPKSKEGY ASIGGGSPLR HITDAQAEEL RKCLWEKNVP AKVYVGMRYW 201: HPFTEEAIEQ IKRDGITKLV VLPLYPQFSI STSGSSLRLL ERIFREDEYL VNMQHTVIPS WYQREGYIKA MANLIQSELG KFGSPNQVVI FFSAHGVPLA 301: YVEEAGDPYK AEMEECVDLI MEELDKRKIT NAYTLAYQSR VGPVEWLKPY TEEAITELGK KGVENLLAVP ISFVSEHIET LEEIDVEYKE LALKSGIKNW 401: GRVPALGTEP MFISDLADAV VESLPYVGAM AVSNLEARQS LVPLGSVEEL LATYDSQRRE LPAPVTMWEW GWTKSAETWN GRAAMLAVLA LLVLEVTTGK 501: GFLHQWGILP SL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)