AT2G30060.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pleckstrin homology (PH) domain superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Pleckstrin homology (PH) domain superfamily protein; FUNCTIONS IN: Ran GTPase binding; INVOLVED IN: intracellular transport, protein import into nucleus, translocation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ran binding protein 1 (InterPro:IPR000156), Pleckstrin homology-type (InterPro:IPR011993); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pleckstrin homology (PH) domain superfamily protein (TAIR:AT1G07140.1); Has 1493 Blast hits to 1181 proteins in 240 species: Archae - 0; Bacteria - 5; Metazoa - 818; Fungi - 349; Plants - 153; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 166 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12827035..12828551 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24390.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 217 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASISNEPER ENRDEEETGA NEDEDTGAQV APIVRLEEVA VTTGEEDEDT ILDLKSKLYR FDKDGSQWKE RGAGTVKFLK HRVSGKIRLV MRQSKTLKIC 101: ANHLVGSGMS VQEHAGNDKS CVWHARDFSD GELKDELFCI RFASVENCKA FMQKFKEVAE SEEEKEESKD ASDTAGLLEK LTVEEKESEK KPVEKAEENK 201: KSEAVEEKKT EESVPSA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)