AT2G29750.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.996 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 71C1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 71C1 (UGT71C1); FUNCTIONS IN: quercetin 3'-O-glucosyltransferase activity, UDP-glycosyltransferase activity, quercetin 7-O-glucosyltransferase activity, UDP-glucosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: inflorescence meristem, hypocotyl, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-glucosyl transferase 71C2 (TAIR:AT2G29740.1); Has 7500 Blast hits to 7461 proteins in 403 species: Archae - 0; Bacteria - 348; Metazoa - 2171; Fungi - 25; Plants - 4881; Viruses - 17; Other Eukaryotes - 58 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12709902..12711347 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53878.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 481 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKQEDAELV IIPFPFSGHI LATIELAKRL ISQDNPRIHT ITILYWGLPF IPQADTIAFL RSLVKNEPRI RLVTLPEVQD PPPMELFVEF AESYILEYVK 101: KMVPIIREAL STLLSSRDES GSVRVAGLVL DFFCVPMIDV GNEFNLPSYI FLTCSAGFLG MMKYLPERHR EIKSEFNRSF NEELNLIPGY VNSVPTKVLP 201: SGLFMKETYE PWVELAERFP EAKGILVNSY TALEPNGFKY FDRCPDNYPT IYPIGPILCS NDRPNLDSSE RDRIITWLDD QPESSVVFLC FGSLKNLSAT 301: QINEIAQALE IVDCKFIWSF RTNPKEYASP YEALPHGFMD RVMDQGIVCG WAPQVEILAH KAVGGFVSHC GWNSILESLG FGVPIATWPM YAEQQLNAFT 401: MVKELGLALE MRLDYVSEDG DIVKADEIAG TVRSLMDGVD VPKSKVKEIA EAGKEAVDGG SSFLAVKRFI GDLIDGVSIS K |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)