AT2G29440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.973 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutathione S-transferase tau 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes glutathione transferase belonging to the tau class of GSTs. Naming convention according to Wagner et al. (2002). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutathione S-transferase tau 6 (GSTU6); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Glutathione S-transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR010987), Glutathione S-transferase/chloride channel, C-terminal (InterPro:IPR017933), Glutathione S-transferase, N-terminal (InterPro:IPR004045), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutathione S-transferase tau 5 (TAIR:AT2G29450.1); Has 8102 Blast hits to 8085 proteins in 1224 species: Archae - 0; Bacteria - 4301; Metazoa - 845; Fungi - 139; Plants - 2030; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 787 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:12620159..12621099 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25619.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 223 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKNEEVKLL GIWASPFSRR IEMALKLKGV PYEYLEEDLE NKSSLLLALS PIHKKIPVLV HNGKTIIESH VILEYIDETW KHNPILPQDP FQRSKARVLA 101: KLVDEKIVNV GFASLAKTEK GREVLIEQTR ELIMCLEKEL AGKDYFGGKT VGFLDFVAGS MIPFCLERAW EGMGVEMITE KKFPEYNKWV KKLKEVEIVV 201: DCIPLREKHI EHMNNMAEKI RSA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)