AT2G28250.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
NCRK; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT1G10620.1); Has 107841 Blast hits to 106732 proteins in 3090 species: Archae - 127; Bacteria - 12810; Metazoa - 39123; Fungi - 9020; Plants - 31343; Viruses - 335; Other Eukaryotes - 15083 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12044004..12046339 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 62195.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 565 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKMRVETALA ILLVLISIQQ CYGGVSNYTC TCFSSGNRSD ILESNCSTSC NCRPDRDQWV CLCPANGFPV IAIGGSNSSC FTSCNCSAGA TKSSKKQYLS 101: RKLVIVILLF CGVLISLAFL ASMICYICRK DKFSGQTPSV SSDRESSWHS SANLINRKSS VSQSKISISS SVAGCFFQNA SLFCVSKPET IHGAIFQFSY 201: TELEQATNKF SSNSVIGHGG SSCVYRGQLK DGKTAAIKRL NTPKGDDTDT LFSTEVELLS RLHHYHVVPL IGYCSEFHGK HAERLLVFEY MSYGSLRDCL 301: DGELGEKMTW NIRISVALGA ARGLEYLHEA AAPRILHRDV KSTNILLDEN WHAKITDLGM AKCLSSDGLQ SGSSSPTTGL QGTFGYFAPE YAIAGCASQM 401: SDVFSFGVVL LELITGRKPI QKPSNNKGEE SLVIWAVPRL QDSKRVIEEL PDPRLNGKFA EEEMQIMAYL AKECLLLDPE SRPTMREVVQ ILSTITPDTS 501: SRRRNFPINY LFQSNEKKKE SKVGWSRGGS KSGQEEETVD LTEPRFESFC LPNVKPVLLE PSAHI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)