AT2G27490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dephospho-CoA kinase family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
AT2G27490 encodes dephospho-CoA kinase. The molecular function was shown to phosphorylate the ribosyl moiety forming CoA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATCOAE; FUNCTIONS IN: ATP binding, dephospho-CoA kinase activity; INVOLVED IN: coenzyme A biosynthetic process; LOCATED IN: peroxisome, chloroplast, vacuole; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dephospho-CoA kinase (InterPro:IPR001977); Has 7074 Blast hits to 7073 proteins in 2608 species: Archae - 1; Bacteria - 4684; Metazoa - 251; Fungi - 135; Plants - 58; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1945 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11748087..11749009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25748.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 232 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRIVGLTGGI ASGKSTVSNL FKASGIPVVD ADVVARDVLK KGSGGWKRVV AAFGEEILLP SGEVDRPKLG QIVFSSDSKR QLLNKLMAPY ISSGIFWEIL 101: KQWASGAKVI VVDIPLLFEV KMDKWTKPIV VVWVSQETQL KRLMERDGLS EEDARNRVMA QMPLDSKRSK ADVVIDNNGS LDDLHQQFEK VLIEIRRPLT 201: WIEFWRSRQG AFSVLGSVIL GLSVCKQLKI GS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)