AT2G26950.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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FP Images |
Arabidopsis cell culture (plastidal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : myb domain protein 104 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Member of the R2R3 factor gene family. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
myb domain protein 104 (MYB104); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SANT, DNA-binding (InterPro:IPR001005), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), Myb, DNA-binding (InterPro:IPR014778), Myb transcription factor (InterPro:IPR015495), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287), HTH transcriptional regulator, Myb-type, DNA-binding (InterPro:IPR017930); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: myb domain protein 81 (TAIR:AT2G26960.1); Has 8267 Blast hits to 7915 proteins in 468 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 560; Fungi - 403; Plants - 5591; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1710 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11500721..11502073 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 43514.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 4.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 382 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIQDQANDLL AMKKTFTKSK WKPEEDRILK DYVIQYGDRT WTHVPKRTGL PHNPASCRFR WMNHLKPSLK KGPFTDEEEK RVLQLHAVLG NKWSQMAREF 101: PGRTDNEIKN FWNARRMRLK GKGLPVYPDE VREQAIRTAA QYGVKVELLN AHYSQDSLMA GNVEKPQELN NLALNQCSPY YQSTLANVQP SRNRVMEPET 201: TFPFTGGSAM NEQNPTLLCN PYVESTQEQL PDSHLFGNVT YSSPPMPLIH EVENLELPSF QGFDFHEEPS SFGAEQYNPM LNLEPHNTLV QSPLIGQTPT 301: DFPSSFYDEL LDELLESVVN GSLGEIPKTD TSSESQLFQS SLRSHTDATP DIANTTGYVG SNERNTTNDD DWIRLLLDEG FI |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)