AT2G26510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Xanthine/uracil permease family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
permease | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
pigment defective embryo 135 (PDE135); FUNCTIONS IN: transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Xanthine/uracil/vitamin C permease (InterPro:IPR006043); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Xanthine/uracil permease family protein (TAIR:AT2G34190.1); Has 9126 Blast hits to 9110 proteins in 1899 species: Archae - 65; Bacteria - 7470; Metazoa - 356; Fungi - 126; Plants - 439; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 669 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:11274118..11277464 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60174.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 551 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVETGHHHQH PPAPAAAGHP PVPSMAMARN MGTTWPPAEQ LHHLQYCIHS NPSWHETVVL AFQHYIVMLG TTVLIANTLV SPMGGDPGDK ARVIQTILFM 101: SGINTLLQTL IGTRLPTVMG VSFAYVLPVL SIIRDYNNGQ FDSEKQRFRH TMRTVQGSLI ISSFVNIIIG YGQAWGNLIR IFSPIIVVPV VSVVSLGLFL 201: RGFPLLANCV EIGLPMLILL IITQQYLKHA FSRISMILER YALLVCLAII WAFAAILTVS GAYNNVSTAT KQSCRTDRAF LMSSAPWIRI PYPFQWGTPI 301: FKASHVFGMF GAAIVASAES TGVFFAASRL AGATAPPAHV VSRSIGLQGI GVLLEGIFGS ITGNTASVEN VGLLGLTRIG SRRVVQVSTF FMIFFSIFGK 401: FGAFFASIPL PIFAGVYCIL LGIVVAVGIS FIQFTDTNSM RNMYVIGVSL FLSLSIAQYF LANTSRAGYG PVRTAGGWFN DILNTIFASA PLVATILATI 501: LDNTLEARHA SDDARGIPWW KPFQHRNGDG RNDEFYSMPL RINELMPTRF L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)