AT2G26230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : uricase / urate oxidase / nodulin 35, putative | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
uricase / urate oxidase / nodulin 35, putative; FUNCTIONS IN: urate oxidase activity, oxidoreductase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, purine base metabolic process; LOCATED IN: peroxisome; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Uricase, conserved site (InterPro:IPR019842), Uricase (InterPro:IPR002042); Has 677 Blast hits to 673 proteins in 262 species: Archae - 5; Bacteria - 239; Metazoa - 140; Fungi - 185; Plants - 90; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 18 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:11164956..11166968 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34882.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 309 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAQEADGIRL DQRHGKARVR VGRVWRHAHD GSHHFVEWNV SISLLSHCLS SYRLDDNSDI VATDTIKNTV YVKAKECGDR LSVEEFAILI GKHFCSFYPQ 101: VFTAIVNIIE KPWERVSIDG KPHLHGFKLG SENHTTEARV EKSGALNLTS GIGGLALLKT TQSGFERFVR DKYTILPETR ERMLATEVNA SWRYSYESVA 201: SIPTKGLYFS EKFMDVKKVL MDTFFGPPET GVYSPSVQRT LYLMGSAVLK RFADVSSIHL KMPNIHFLPV NLSTKENPSM VKFKDDVYLP TDEPHGSIEA 301: TLSRITSKL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)