AT2G26140.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FTSH protease 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes an FtsH protease that is localized to the mitochondrion | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
FTSH protease 4 (ftsh4); FUNCTIONS IN: metallopeptidase activity, ATP-dependent peptidase activity, ATPase activity; INVOLVED IN: proteolysis, protein catabolic process; LOCATED IN: mitochondrion, plastid, membrane; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M41, FtsH (InterPro:IPR005936), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ATPase, AAA-type, core (InterPro:IPR003959), ATPase, AAA-type, conserved site (InterPro:IPR003960), Peptidase M41 (InterPro:IPR000642), Peptidase S16, Lon protease, C-terminal (InterPro:IPR001984); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FTSH protease 11 (TAIR:AT5G53170.1); Has 39775 Blast hits to 37259 proteins in 3240 species: Archae - 1584; Bacteria - 15744; Metazoa - 5149; Fungi - 3764; Plants - 3335; Viruses - 40; Other Eukaryotes - 10159 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11131939..11135126 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 77279.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 717 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAWRRIITKV SSHERELSSL RSLLVRAYSS FPRVGVTGAV GGGGASLPRT RFQSSYVGSF ARRVRDREEV NEVAHLRELI RRNDPEAVIR MFESQPSLHA 101: NASALSEYIK ALVKVDRLDQ SELVRTLQRG IAGVAREEET FGGLGAFRNV GKPTKDGVLG TASAPIHTIS TERTHFKEQL WSTIRTIGVG FLLISGIGAL 201: IEDRGIGKGL GLHEEVQPSM DSSTKFSDVK GVDEAKAELE EIVHYLRDPK RFTRLGGKLP KGVLLVGPPG TGKTMLARAI AGEAGVPFFS CSGSEFEEMF 301: VGVGARRVRD LFSAAKKCSP CIIFIDEIDA IGGSRNPKDQ QYMKMTLNQM LVELDGFKQN EGIIVVAATN FPESLDKALV RPGRFDRHIV VPNPDVEGRR 401: QILESHMSKV LKAEDVDLMI IARGTPGFSG ADLANLVNVA ALKAAMDGSK DVTMSDLEFA KDRIMMGSER KSAVISDESR KLTAFHEGGH ALVAIHTEGA 501: LPVHKATIVP RGMALGMVSQ LPDKDETSIS RKQMLARLDV CMGGRVAEEL IFGESEVTSG ASSDLEQATK LARAMVTKFG MSKEVGLVAH NYDDNGKSMS 601: TETRLLIESE VKQLLEKAYN NAKTILTVYN KELHALANAL LQHETLSGKQ IKELLTDLNS PLLQKRQEVV TKQSNPVPPS TPSSASSAAA AAAAAAAAAA 701: AAAATAATKG KDMAPVS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)