AT2G25870.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein; FUNCTIONS IN: metallopeptidase activity, hydrolase activity, catalytic activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: metabolic process; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Uncharacterised protein family UPF0054, conserved site (InterPro:IPR020549), Cof protein (InterPro:IPR000150), HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB (InterPro:IPR006379), HAD superfamily hydrolase-like, type 3 (InterPro:IPR013200), Uncharacterised protein family UPF0054 (InterPro:IPR002036); Has 22843 Blast hits to 22827 proteins in 2747 species: Archae - 229; Bacteria - 20428; Metazoa - 41; Fungi - 14; Plants - 67; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2064 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:11031159..11034302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 65309.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 584 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLSRVCPTLR YNRIWSAHAR EMPRATLLLL QPNFFHSSPK TALVNRLDVT SSEFSSMFRR SFHALRSTVG DWRKLPKPPG QVFAERREYR KIRRRAPKKK 101: QELELSVSIC IEEQLPDDLE IQNIAEMLRL NVPMAMTLAF NGLKDSKYKT RETDIEDLGG YETVELSVML CNDDFICKLN KEWRGEDHAT DVLSMSQHVP 201: ELKLPVLMMG DLVISVETAA RQAAERGHTL LDEIRILVIH GLLHLLGFDH EISDEAEQEM EEEEELLLKN LGWKGKGLIQ SAYDIQKTTT VQPEKSDDRK 301: EGDGLRLYKP KFSYIFCDMD GTLLNSKSQI SEANAKALKE ALLRGLKVVI ATGKSRPGAI RILKTADLTG SDGIISESSP GVFVQGLLVY GRQGKEVYRG 401: NLDRDVCRET CLYSLEHRIP LIAFSQDRCL TLFDHPLVDS LHTIYNEPKA EIISSVDQLI AEADIQKVIF MDTTEGVSSV IRPYWSEATG DRANVVQAQS 501: DMLEIVPPGT SKGNGVKMLL NHLGVSPDEI MAIGDGENDI EMLQLASLGV ALSNGAEKTK AVADVIGVSN DQDGVADAIY RYAF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)