AT2G25080.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutathione peroxidase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes glutathione peroxidase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutathione peroxidase 1 (GPX1); FUNCTIONS IN: glutathione peroxidase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, response to oxidative stress; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast stroma, chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336), Glutathione peroxidase (InterPro:IPR000889); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutathione peroxidase 7 (TAIR:AT4G31870.1); Has 7896 Blast hits to 7895 proteins in 1765 species: Archae - 2; Bacteria - 4003; Metazoa - 799; Fungi - 210; Plants - 390; Viruses - 8; Other Eukaryotes - 2484 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:10668134..10669828 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26017.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 236 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSMTTSSSS YGTFSTVVNS SRPNSSATFL VPSLKFSTGI SNFANLSNGF SLKSPINPGF LFKSRPFTVQ ARAAAEKTVH DFTVKDIDGK DVALNKFKGK 101: VMLIVNVASR CGLTSSNYSE LSHLYEKYKT QGFEILAFPC NQFGFQEPGS NSEIKQFACT RFKAEFPIFD KVDVNGPSTA PIYEFLKSNA GGFLGGLIKW 201: NFEKFLIDKK GKVVERYPPT TSPFQIEKDI QKLLAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)