AT2G24520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : H(+)-ATPase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
H(+)-ATPase 5 (HA5); FUNCTIONS IN: ATPase activity; INVOLVED IN: cation transport, metabolic process, ATP biosynthetic process; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, P-type, ATPase-associated domain (InterPro:IPR008250), ATPase, P-type, H+ transporting proton pump (InterPro:IPR000695), ATPase, P-type cation-transporter, N-terminal (InterPro:IPR004014), Haloacid dehalogenase-like hydrolase (InterPro:IPR005834), ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter (InterPro:IPR001757), ATPase, P-type, plasma-membrane proton-efflux (InterPro:IPR006534), ATPase, P-type phosphorylation site (InterPro:IPR018303); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: H(+)-ATPase 2 (TAIR:AT4G30190.1); Has 37354 Blast hits to 32806 proteins in 3183 species: Archae - 691; Bacteria - 24060; Metazoa - 3886; Fungi - 2499; Plants - 1868; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 4347 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:10415522..10419730 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 102668.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 931 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEEVFEELKC TKQGLTANEA SHRLDVFGPN KLEEKKESKL LKFLGFMWNP LSWVMEVAAL MAIALANGGG RPPDWQDFVG IVCLLLINST ISFIEENNAG 101: NAAAALMAGL APKTKVLRDN QWSEQEASIL VPGDVISIKL GDIIPADARL LDGDPLKIDQ SSLTGESIPV TKNPSDEVFS GSICKQGEIE AIVIATGVHT 201: FFGKAAHLVD NTNQIGHFQK VLTSIGNFCI CSIALGIIVE LLVMYPIQRR RYRDGIDNLL VLLIGGIPIA MPSVLSVTMA TGSHRLFQQG AITKRMTAIE 301: EMAGMDVLCC DKTGTLTLNK LTVDKNLVEV FAKGVGKEHV FLLAARASRI ENQDAIDAAI VGMLADPKEA RAGVREVHFF PFNPVDKRTA LTYVDSDGNW 401: HRASKGAPEQ ILNLCNCKED VRRKVHGVID KFAERGLRSL AVARQEVLEK KKDAPGGPWQ LVGLLPLFDP PRHDSAETIR RALNLGVNVK MITGDQLAIG 501: KETGRRLGMG TNMYPSSALL GQVKDSSLGA LPVDELIEKA DGFAGVFPEH KYEIVHRLQQ RNHICGMTGD GVNDAPALKK ADIGIAVVDA TDAARGASDI 601: VLTEPGLSVI ISAVLTSRAI FQRMKNYTIY AVSITIRIVF GFMFIALIWQ FDFSPFMVLI IAILNDGTIM TISKDRMKPS PQPDSWKLRD IFSTGVVLGG 701: YQALMTVVFF WVMKDSDFFS NYFGVRPLSQ RPEQMMAALY LQVSIISQAL IFVTRSRSWS YAECPGLLLL GAFVIAQLVA TFIAVYANWS FARIEGAGWG 801: WAGVIWLYSF LTYIPLDLLK FGIRYVLSGK AWLNLLENKT AFTTKKDYGK EEREAQWAAA QRTLHGLQPA EKNNIFNEKN SYSELSQIAE QAKRRAEVVR 901: LREINTLKGH VESVVKLKGL DIDTIQQHYT V |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)