AT2G24180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome p450 71b6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
cytochrome P450 monooxygenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome p450 71b6 (CYP71B6); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: mitochondrion, endoplasmic reticulum, plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 37 (TAIR:AT3G26330.1); Has 32387 Blast hits to 32166 proteins in 1619 species: Archae - 48; Bacteria - 2986; Metazoa - 11709; Fungi - 7043; Plants - 9512; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1086 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:10281890..10283589 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57012.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 503 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLFSFPIST ELLPWLLLLL IPPLLIFFLL RSPKNLPPGP PRLPILGNIH QLGSLPHRSL RDLSLKYGPV ITVYLGSVRT VVVHSPETAE EVLKLHDSEC 101: CTRPKLSITK SFFYDGLGLG FTKWGDYYRD VRKLCVLELF SVKRANSFRN IREEELSRLV NSFSDSASSG SSVDLTANLA KFVASFTCRM AFGLSFQGSG 201: MDNETFLELF TEANRVIGKF AAADIFPGFG WILDRISGLD SSRRKSFQDL DTFYQKAIVD HREKKKTEDR EDLIDVLLKL QSQETKLGSS RITDTHIRAI 301: IMDLFVAGVD TSVITLDWTM AELSRHPRVM KKVQAEIREH VGDKGIVTYD DLEALVYMKM VIKETWRLHA PSPILIPREA MTNFKIKGYD IYPGTRIHVN 401: AWAIGRNPDV WKDPDEFIPE RFVDSNVETK GTSFELLPFG SGRRGCPAMY VGLSTVEYTL ANLLYHFDWK ATEEVSVEEA PGLTSHRKHP LHLVPVNVIN 501: RKL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)