AT2G23610.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.999 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : methyl esterase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein shown to have carboxylesterase activity, methyl IAA esterase activity, and methyl jasmonate esterase activity in vitro. This protein does not act on methyl salicylate, MeGA4, or MEGA9 in vitro. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
methyl esterase 3 (MES3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Alpha/beta hydrolase fold-1 (InterPro:IPR000073); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: methyl esterase 4 (TAIR:AT2G23580.1); Has 1894 Blast hits to 1892 proteins in 428 species: Archae - 2; Bacteria - 1086; Metazoa - 0; Fungi - 17; Plants - 628; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 161 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:10044410..10046403 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29825.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 263 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSEEERKQHV VLVHGACHGA WCWYKVKPQL EASGHRVTAV DLAASGIDMT RSITDISTCE QYSEPLMQLM TSLPDDEKVV LVGHSLGGLS LAMAMDMFPT 101: KISVSVFVTA MMPDTKHSPS FVWDKLRKET SREEWLDTVF TSEKPDFPSE FWIFGPEFMA KNLYQLSPVQ DLELAKMLVR ANPLIKKDMA ERRSFSEEGY 201: GSVTRIFIVC GKDLVSPEDY QRSMISNFPP KEVMEIKDAD HMPMFSKPQQ LCALLLEIAN KYA |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)