AT2G23510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : spermidine disinapoyl acyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
spermidine disinapoyl acyltransferase (SDT); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Transferase (InterPro:IPR003480); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HXXXD-type acyl-transferase family protein (TAIR:AT2G25150.1); Has 2265 Blast hits to 2257 proteins in 134 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 42; Plants - 2219; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:10011517..10013533 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50379.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 451 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPIHIGSSIP LMVEKMLTEM VKPSKHIPQQ TLNLSTLDND PYNEVIYKAC YVFKAKNVAD DDNRPEALLR EALSDLLGYY YPLSGSLKRQ ESDRKLQLSC 101: GGDGGGVPFT VATANVELSS LKNLENIDSD TALNFLPVLH VDIDGYRPFA LQVTKFECGG FILGMAMSHA MCDGYGEGHI MCALTDLAGG KKKPMVTPIW 201: ERERLVGKPE DDQPPFVPGD DTAASPYLPT DDWVTEKITI RADSIRRLKE ATLKEYDFSN ETITTFEVIG AYLWKSRVKA LNLDRDGVTV LGLSVGIRNV 301: VDPPLPDGYY GNAYIDMYVP LTAREVEEFT ISDIVKLIKE AKRNAHDKDY LQEELANTEK IIKMNLTIKG KKDGLFCLTD WRNIGIFGSM DFGWDEPVNI 401: VPVVPSETAR TVNMFMRPSR LESDMVGGVQ IVVTLPRIAM VKFKEEMEAL E |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)