AT2G23450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EGF-like (InterPro:IPR006210), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT5G66790.1); Has 113981 Blast hits to 112485 proteins in 3193 species: Archae - 103; Bacteria - 12981; Metazoa - 41291; Fungi - 9532; Plants - 32683; Viruses - 360; Other Eukaryotes - 17031 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:9988926..9991244 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 77876.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 708 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLRSIFDFNQ RSTKMVMISH KLDLILVFII VIGGSIFRRV SANFTVPCNG RCGGLTLPYP FGFSNGCSIR FDCSAAEKPM IGDFSVQNVT ENSIFVGLSH 101: NCTRKIEDMN PLFGENFAPT SENSFLMENC NRTTDGCSIK QKFLENVLKL KSCDATGNIS CFSLDSNSSS KNSAKFFSMK TLRNSSCSLL FSSIAFESVG 201: VNAGIALEFE RVRLGWWLKG GCESGTCAAN TDCTDVETPH GYAGHRCSCL DGFHGDGYTN PCQRALPECR GSKLVWRHCR SNLITIVGGT VGGAFLLAAL 301: AFFFFCKRRR STPLRSHLSA KRLLSEAAGN SSVAFFPYKE IEKATDGFSE KQKLGIGAYG TVYRGKLQND EWVAIKRLRH RDSESLDQVM NEIKLLSSVS 401: HPNLVRLLGC CIEQGDPVLV YEYMPNGTLS EHLQRDRGSG LPWTLRLTVA TQTAKAIAYL HSSMNPPIYH RDIKSTNILL DYDFNSKVAD FGLSRLGMTE 501: SSHISTAPQG TPGYLDPQYH QCFHLSDKSD VYSFGVVLAE IITGLKVVDF TRPHTEINLA ALAVDKIGSG CIDEIIDPIL DLDLDAWTLS SIHTVAELAF 601: RCLAFHSDMR PTMTEVADEL EQIRLSGWIP SMSLDSPAGS LRSSDRGSER SVKQSSIGSR RVVIPQKQPD CLASVEEISD SSPISVQDPW LSAQSSPSTN 701: TLLGNIPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)