AT2G22990.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : sinapoylglucose 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
sinapoylglucose:malate sinapoyltransferase. Catalyzes the formation of sinapoylmalate from sinapoylglucose. Mutants accumulate excess sinapoylglucose. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sinapoylglucose 1 (SNG1); FUNCTIONS IN: sinapoylglucose-malate O-sinapoyltransferase activity, serine-type carboxypeptidase activity; INVOLVED IN: phenylpropanoid metabolic process, proteolysis; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S10, serine carboxypeptidase (InterPro:IPR001563); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine carboxypeptidase-like 9 (TAIR:AT2G23010.1); Has 3959 Blast hits to 3880 proteins in 457 species: Archae - 0; Bacteria - 470; Metazoa - 646; Fungi - 843; Plants - 1550; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 450 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9786393..9789925 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49441.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 433 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLKIKFLLL LVLYHHVDSA SIVKFLPGFE GPLPFELETG YIGIGEDENV QFFYYFIKSE NNPKEDPLLI WLNGGPGCSC LGGIIFENGP VGLKFEVFNG 101: SAPSLFSTTY SWTKMANIIF LDQPVGSGFS YSKTPIDKTG DISEVKRTHE FLQKWLSRHP QYFSNPLYVV GDSYSGMIVP ALVQEISQGN YICCEPPINL 201: QGYMLGNPVT YMDFEQNFRI PYAYGMGLIS DEIYEPMKRI CNGNYYNVDP SNTQCLKLTE EYHKCTAKIN IHHILTPDCD VTNVTSPDCY YYPYHLIECW 301: ANDESVREAL HIEKGSKGKW ARCNRTIPYN HDIVSSIPYH MNNSISGYRS LIYSGDHDIA VPFLATQAWI RSLNYSPIHN WRPWMINNQI AGYTRAYSNK 401: MTFATIKGGG HTAEYRPNET FIMFQRWISG QPL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)