AT2G22330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.978 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 79, subfamily B, polypeptide 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cytochrome P450. Involved in tryptophan metabolism. Converts Trp to indole-3-acetaldoxime (IAOx), a precursor to IAA and indole glucosinolates. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 79, subfamily B, polypeptide 3 (CYP79B3); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: in 10 processes; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 79, subfamily B, polypeptide 2 (TAIR:AT4G39950.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9488601..9490983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61441.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 543 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDTLASNSSD LTTKSSLGMS SFTNMYLLTT LQALAALCFL MILNKIKSSS RNKKLHPLPP GPTGFPIVGM IPAMLKNRPV FRWLHSLMKE LNTEIACVRL 101: GNTHVIPVTC PKIAREIFKQ QDALFASRPL TYAQKILSNG YKTCVITPFG EQFKKMRKVI MTEIVCPARH RWLHDNRAEE TDHLTAWLYN MVKNSEPVDL 201: RFVTRHYCGN AIKRLMFGTR TFSEKTEADG GPTLEDIEHM DAMFEGLGFT FAFCISDYLP MLTGLDLNGH EKIMRESSAI MDKYHDPIID ERIKMWREGK 301: RTQIEDFLDI FISIKDEAGQ PLLTADEIKP TIKELVMAAP DNPSNAVEWA IAEMINKPEI LHKAMEEIDR VVGKERFVQE SDIPKLNYVK AIIREAFRLH 401: PVAAFNLPHV ALSDTTVAGY HIPKGSQVLL SRYGLGRNPK VWSDPLSFKP ERHLNECSEV TLTENDLRFI SFSTGKRGCA APALGTAITT MMLARLLQGF 501: KWKLAGSETR VELMESSHDM FLSKPLVLVG ELRLSEDLYP MVK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)