AT2G21650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Homeodomain-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
RSM1 is a member of a small sub-family of single MYB transcription factors. Analysis of overexpressin lines indicate its involvement during early morphogenesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MATERNAL EFFECT EMBRYO ARREST 3 (MEE3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SANT, DNA-binding (InterPro:IPR001005), Molecular chaperone, heat shock protein, Hsp40, DnaJ (InterPro:IPR015609), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), MYB-like (InterPro:IPR017877); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RAD-like 1 (TAIR:AT4G39250.1); Has 548 Blast hits to 547 proteins in 63 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 92; Fungi - 0; Plants - 453; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9259654..9260419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 11508.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 101 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASGSMSSYG SGSWTVKQNK AFERALAVYD QDTPDRWHNV ARAVGGKTPE EAKRQYDLLV RDIESIENGH VPFPDYKTTT GNSNRGRLRD EEKRMRSMKL 101: Q |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)