AT2G21280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
A nuclear-encoded, plastid-targeted protein (AtSulA) whose overexpression causes severe yet stochastic plastid (shown in chloroplasts and leucoplasts) division defects. The protein does not appear to interact with either AtFtsZ proteins when studied in a yeast two-hybrid system. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
SULA; FUNCTIONS IN: coenzyme binding, binding, catalytic activity; INVOLVED IN: chloroplast fission; LOCATED IN: chloroplast, plastid, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar nucleotide epimerase YfcH, putative (InterPro:IPR010099), NAD-dependent epimerase/dehydratase (InterPro:IPR001509), Domain of unknown function DUF1731, C-terminal (InterPro:IPR013549), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein (TAIR:AT4G33360.2); Has 4854 Blast hits to 4853 proteins in 1452 species: Archae - 38; Bacteria - 3329; Metazoa - 111; Fungi - 30; Plants - 185; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1161 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:9110502..9112679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37747.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 347 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELLCSPTSL SSSFALSSAL LVPRSFSMPG TRRFMVLCSS QKESQMTVSV TGATGFIGRR LVQRLRADNH AIRVLTRSKS KAEQIFPAKD FPGIVIAEES 101: EWKNCVQGST AVVNLAGLPI STRWSPEIKK EIKGSRIRVT SKVVDLINNS PAEARPTVLV SATAVGYYGT SETGVFDENS PSGKDYLAEV CREWEGTALK 201: ANKDVRVALI RIGVVLGKDG GALAMMIPFF QMFAGGPLGS GQQWFSWIHV DDLVNLIYEA LTNPSYKGVI NGTAPNPVRL GEMCQQLGSV LSRPSWLPVP 301: DFALKALLGE GATVVLEGQK VLPVRAKELG FEFKYKYVKD ALRAIMQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)