AT2G21140.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : proline-rich protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Proline-rich protein expressed in expanding leaves, stems, flowers, and siliques. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
proline-rich protein 2 (PRP2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pollen Ole e 1 allergen/extensin (InterPro:IPR006041); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: proline-rich protein 4 (TAIR:AT4G38770.1); Has 15440 Blast hits to 6990 proteins in 709 species: Archae - 42; Bacteria - 1645; Metazoa - 5634; Fungi - 879; Plants - 4869; Viruses - 674; Other Eukaryotes - 1697 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:9060868..9062035 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35509.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 321 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRILPKSGGG ALCLLFVFAL CSVAHSLSCD VKVVGDVEVI GYSEISKIKI PNAFSGLRVT IECKAADSKG HFVTRGSGEV DETGKFHLNI PHDIVGDDGT 101: LKEACYAHLQ SAFGNPCPAH DGLEASKIVF LSKSGQNHVL GLKKSLKFSP EVCISKFFWH MPKFPLPPPL NLPPLTFPKI KKPCPPIYKP PVVIPKKPCP 201: PKIAHKPIYK PPVPIYKPPV PIYKPPVVIP KKPCPPKIHK PIYKPPVPIY KPPVVIPKKT FPPLHKPIYK HPVPIYKPIF KPPVVVIPKK PCPPLPKFPH 301: FPPKYIPHPK FGKWPPFPSH P |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)