AT2G20520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FASCICLIN-like arabinogalactan 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
fasciclin-like arabinogalactan-protein 6 (Fla6) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
FASCICLIN-like arabinogalactan 6 (FLA6); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FAS1 domain (InterPro:IPR000782); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FASCICLIN-like arabinoogalactan 9 (TAIR:AT1G03870.1); Has 1085 Blast hits to 1063 proteins in 208 species: Archae - 14; Bacteria - 391; Metazoa - 4; Fungi - 7; Plants - 614; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 55 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:8840663..8841406 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26507.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 247 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSSLFSYVV LLIFLFTIPY IQSQPTAPAP TTEKSPINLT AILEAGHQFT TLIQLLNTTQ VGFQVSVQLN SSDQGMTIFA PTDNAFNKLK PGTLNSLTYQ 101: QQIQLMLYHI IPKYYSLSDL LLASNPVRTQ ATGQDGGVFG LNFTGQAQSN QVNVSTGVVE TRINNALRQQ FPLAVYVVDS VLLPEELFGT KTTPTGAPAP 201: KSSTSSSDAD SPAADDEHKS AGSSVKRTSL GIVVSFALFC CSVIYIA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)