AT2G18400.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ribosomal protein L6 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ribosomal protein L6 family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome, rRNA binding; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: ribosome, intracellular, large ribosomal subunit; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L6 (InterPro:IPR000702), Ribosomal protein L6, bacterial-type (InterPro:IPR019906), Ribosomal protein L6, alpha-beta domain (InterPro:IPR020040), Ribosomal protein L6, conserved site (InterPro:IPR002358); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein L6 family (TAIR:AT1G05190.1); Has 7681 Blast hits to 7681 proteins in 2698 species: Archae - 1; Bacteria - 5446; Metazoa - 4; Fungi - 120; Plants - 122; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1988 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:7989665..7989973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 11590.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 102 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEAKFFRFLK IVGVGYKARA EEAGRFLYLK LGYSHEVELA VPPAVRVFCF KNNVVCCTGI DKQRVHQFAA TVRSCKPPEP YKGKGIMYTD EVVKKKQGKK 101: SK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)