AT2G18250.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 4-phosphopantetheine adenylyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
At2g18250 encodes pantetheine-phosphate adenylyltransferase catalyzing the formation of dephospho-CoA from pantetheine 4'-phosphate. The enzyme is involved in coenzyme A biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
4-phosphopantetheine adenylyltransferase (COAD); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Cytidyltransferase-related (InterPro:IPR004821), Cytidylyltransferase (InterPro:IPR004820); Has 633 Blast hits to 630 proteins in 285 species: Archae - 179; Bacteria - 4; Metazoa - 125; Fungi - 130; Plants - 59; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 136 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:7940025..7941499 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19169.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 176 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAPEDSKMS PANSFGAVVL GGTFDRLHDG HRMFLKAAAE LARDRIVVGV CDGPMLTKKQ FSDMIQPIEE RMRNVETYVK SIKPELVVQA EPITDPYGPS 101: IVDENLEAIV VSKETLPGGL SVNRKRAERG LSQLKIEVVE IVSDGSSGNK ISSSTLRKME AEKASKQKQP AEEKAS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)