AT2G18230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pyrophosphorylase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein that might have inorganic pyrophosphatase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
pyrophosphorylase 2 (PPa2); FUNCTIONS IN: inorganic diphosphatase activity, pyrophosphatase activity; INVOLVED IN: phosphate metabolic process, metabolic process; LOCATED IN: membrane, cytoplasm; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Inorganic pyrophosphatase (InterPro:IPR008162); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: pyrophosphorylase 4 (TAIR:AT3G53620.1); Has 5938 Blast hits to 5938 proteins in 1818 species: Archae - 171; Bacteria - 4270; Metazoa - 244; Fungi - 258; Plants - 268; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 727 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:7932139..7933560 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24672.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 218 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEIKDEGSA KGYAFPLRNP NVTLNERNFA AFTHRSAAAH PWHDLEIGPE APTVFNCVVE ISKGGKVKYE LDKNSGLIKV DRVLYSSIVY PHNYGFIPRT 101: ICEDSDPMDV LVLMQEPVLT GSFLRARAIG LMPMIDQGEK DDKIIAVCAD DPEFRHYRDI KELPPHRLAE IRRFFEDYKK NENKKVDVEA FLPAQAAIDA 201: IKDSMDLYAA YIKAGLQR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)