AT2G18170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.952 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MAP kinase 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
MAP kinase 7 (MPK7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), MAP kinase, conserved site (InterPro:IPR003527), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: mitogen-activated protein kinase 14 (TAIR:AT4G36450.1); Has 121649 Blast hits to 120256 proteins in 4623 species: Archae - 97; Bacteria - 12437; Metazoa - 46483; Fungi - 12286; Plants - 29603; Viruses - 478; Other Eukaryotes - 20265 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:7908178..7909374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42301.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 368 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMLVEPPNG IKQQGKHYYS MWQTLFEIDT KYVPIKPIGR GAYGVVCSSI NRETNERVAI KKIHNVFENR VDALRTLREL KLLRHVRHEN VIALKDVMLP 101: ANRSSFKDVY LVYELMDTDL HQIIKSSQSL SDDHCKYFLF QLLRGLKYLH SANILHRDLK PGNLLVNANC DLKICDFGLA RTSQGNEQFM TEYVVTRWYR 201: APELLLCCDN YGTSIDVWSV GCIFAEILGR KPIFPGTECL NQLKLIINVV GSQQESDIRF IDNPKARRFI KSLPYSRGTH LSNLYPQANP LAIDLLQRML 301: VFDPTKRISV TDALLHPYMA GLFDPGSNPP AHVPISLDID ENMEEPVIRE MMWNEMLYYH PEAEISNA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)