AT2G17570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.897 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Undecaprenyl pyrophosphate synthetase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Undecaprenyl pyrophosphate synthetase family protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring alkyl or aryl (other than methyl) groups; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase-like, conserved site (InterPro:IPR018520), Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase-like (InterPro:IPR001441); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Undecaprenyl pyrophosphate synthetase family protein (TAIR:AT5G60510.1); Has 9017 Blast hits to 8995 proteins in 2779 species: Archae - 230; Bacteria - 5298; Metazoa - 197; Fungi - 223; Plants - 211; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2858 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:7645086..7645973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33629.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 295 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAELPGQIRH IGGRMSQLLE QIYGFSRRSL FRVISMGPIP CHIAFIMDGN RRYAKKCGLL DGSGHKAGFS ALMSMLQYCY ELGIKYVTIY AFSIDNFRRK 101: PEEVESVMDL MLEKIKSLLE KESIVHQYGI RVYFIGNLAL LNDQVRAAAE KVMKATAKNS RVVLLICIAY NSTDEIVQAV KKSCINKSDN IEASNYKHED 201: SDSDIEGTDM ENQEKKIQLV DIEENMQMSV APNPDILIRS SGETRLSNFL LWQTGNTQLC SPAALWPEIG LRHLLWAILN FQRNHSYLEK RKKQL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)