AT2G17340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Uncharacterised conserved protein (UCP030210) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Uncharacterised conserved protein (UCP030210); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Domain of unknown function DUF89 (InterPro:IPR002791), Uncharacterised conserved protein UCP030210 (InterPro:IPR016949); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Uncharacterised conserved protein (UCP030210) (TAIR:AT4G35360.1); Has 357 Blast hits to 356 proteins in 130 species: Archae - 52; Bacteria - 55; Metazoa - 104; Fungi - 0; Plants - 135; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 11 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:7541615..7544089 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40859.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 367 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESDSEMVPF PQLPMPIENN YRACTIPYRF PSDDPKKATP NEISWINVFA NSIPSFKKRA ESDITVPDAP ARAEKFAERY AGILEDLKKD PESHGGPPDG 101: ILLCRLREQV LRELGFRDIF KKVKDEENAK AISLFPQVVS LSDAIEDDGK RLENLVRGIF AGNIFDLGSA QLAEVFSRDG MSFLASCQNL VPRPWVIDDL 201: ENFQAKWINK SWKKAVIFVD NSGADIILGI LPFARELLRR GAQVVLAANE LPSINDITCT ELTEILSQLK DENGQLLGVD TSKLLIANSG NDLPVIDLSR 301: VSQELAYLSS DADLVIVEGM GRGIETNLYA QFKCDSLKIG MVKHLEVAEF LGGRLYDCVF KFNEVQS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)