AT2G03410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.990 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mo25 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Mo25 family protein; FUNCTIONS IN: binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: sepal, male gametophyte, flower, stamen, pollen tube; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mo25-like (InterPro:IPR013878), Armadillo-type fold (InterPro:IPR016024); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mo25 family protein (TAIR:AT5G47540.1); Has 558 Blast hits to 558 proteins in 186 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 211; Fungi - 140; Plants - 153; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 54 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:1033907..1034953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40002.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 348 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKGLFKNKSR LPGEIVRQTR DLIALAESEE EETDARNSKR LGICAELCRN IRDLKSILYG NGEAEPVPEA CLLLTQEFFR ADTLRPLIKS IPKLDLEARK 101: DATQIVANLQ KQQVEFRLVA SEYLESNLDV IDSLVEGIDH DHELALHYTG MLKECVRHQV VAKYILESKN LEKFFDYVQL PYFDVATDAS KIFRELLTRH 201: KSTVAEYLAK NYEWFFAEYN TKLLEKGSYF TKRQASKLLG DVLMDRSNSG VMVKYVSSLD NLRIMMNLLR EPTKNIQLEA FHIFKLFVAN ENKPEDIVAI 301: LVANRTKILR LFADLKPEKE DVGFETDKAL VMNEIATLSL LDIKTADR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)