AT2G03340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WRKY DNA-binding protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes WRKY DNA-binding protein 3 (WRKY3). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WRKY DNA-binding protein 3 (WRKY3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding WRKY (InterPro:IPR003657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WRKY DNA-binding protein 4 (TAIR:AT1G13960.1); Has 6486 Blast hits to 3819 proteins in 292 species: Archae - 2; Bacteria - 20; Metazoa - 337; Fungi - 90; Plants - 5675; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 359 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:1014724..1016936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56287.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 513 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEKEEKEPS KLKSSTGVSR PTISLPPRPF GEMFFSGGVG FSPGPMTLVS NLFSDPDEFK SFSQLLAGAM ASPAAAAVAA AAVVATAHHQ TPVSSVGDGG 101: GSGGDVDPRF KQSRPTGLMI TQPPGMFTVP PGLSPATLLD SPSFFGLFSP LQGTFGMTHQ QALAQVTAQA VQGNNVHMQQ SQQSEYPSST QQQQQQQQQA 201: SLTEIPSFSS APRSQIRASV QETSQGQRET SEISVFEHRS QPQNADKPAD DGYNWRKYGQ KQVKGSDFPR SYYKCTHPAC PVKKKVERSL DGQVTEIIYK 301: GQHNHELPQK RGNNNGSCKS SDIANQFQTS NSSLNKSKRD QETSQVTTTE QMSEASDSEE VGNAETSVGE RHEDEPDPKR RNTEVRVSEP VASSHRTVTE 401: PRIIVQTTSE VDLLDDGYRW RKYGQKVVKG NPYPRSYYKC TTPDCGVRKH VERAATDPKA VVTTYEGKHN HDVPAARTSS HQLRPNNQHN TSTVNFNHQQ 501: PVARLRLKEE QIT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)