AT2G02810.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 ASURE: endoplasmic reticulum What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-galactose transporter 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a multitransmembrane hydrophobic protein that functions as transporter of UDP-galactose and UDP-glucose into the Golgi. Localized in the ER. Involved in the unfolded protein response, a mechanism that controls proper protein folding in the ER. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
UDP-galactose transporter 1 (UTR1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UAA transporter (InterPro:IPR013657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-galactose transporter 3 (TAIR:AT1G14360.1); Has 1052 Blast hits to 1046 proteins in 233 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 503; Fungi - 150; Plants - 232; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 167 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:801643..803289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36961.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 332 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEVHGSGFRR ILLLALCISG IWSAYIYQGV LQETLSTKRF GPDEKRFEHL AFLNLAQSVV CLIWSYIMIK LWSNAGNGGA PWWTYWSAGI TNTIGPAMGI 101: EALKYISYPA QVLAKSSKMI PVMLMGTLVY GIRYTFPEYM CTFLVAGGVS IFALLKTSSK TISKLAHPNA PLGYALCSLN LAFDGFTNAT QDSIASRYPK 201: TEAWDIMLGM NLWGTIYNMI YMFGLPQGIG FKAIQFCKLH PEAAWDILKY CICGAVGQNF IFMTISNFGS LANTTITTTR KFVSIVVSSV MSGNPLSLKQ 301: WGCVSMVFGG LAYQIYLKWK KLQRVEKKKQ KS |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)