AT2G02750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pentatricopeptide repeat (InterPro:IPR002885); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein (TAIR:AT2G13600.1); Has 42683 Blast hits to 13925 proteins in 241 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 114; Fungi - 172; Plants - 41670; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 723 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:771641..773482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67939.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 613 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MINLTRQRYR VSNLVTGGTS LDVILSHSPN KFTFPPLLKS CAKLGDVVQG RILHAQVVKT GFFVDVFTAT ALVSMYMKVK QVTDALKVLD EMPERGIASV 101: NAAVSGLLEN GFCRDAFRMF GDARVSGSGM NSVTVASVLG GCGDIEGGMQ LHCLAMKSGF EMEVYVGTSL VSMYSRCGEW VLAARMFEKV PHKSVVTYNA 201: FISGLMENGV MNLVPSVFNL MRKFSSEEPN DVTFVNAITA CASLLNLQYG RQLHGLVMKK EFQFETMVGT ALIDMYSKCR CWKSAYIVFT ELKDTRNLIS 301: WNSVISGMMI NGQHETAVEL FEKLDSEGLK PDSATWNSLI SGFSQLGKVI EAFKFFERML SVVMVPSLKC LTSLLSACSD IWTLKNGKEI HGHVIKAAAE 401: RDIFVLTSLI DMYMKCGLSS WARRIFDRFE PKPKDPVFWN VMISGYGKHG ECESAIEIFE LLREEKVEPS LATFTAVLSA CSHCGNVEKG SQIFRLMQEE 501: YGYKPSTEHI GCMIDLLGRS GRLREAKEVI DQMSEPSSSV YSSLLGSCRQ HLDPVLGEEA AMKLAELEPE NPAPFVILSS IYAALERWED VESIRQVIDQ 601: KQLVKLPGLS LSG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)