AT2G02500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (plastidal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with 4-Diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase activity. The enzyme has an absolute requirement for divalent cations (Mg2+ reaches the highest catalytic activity). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ISPD; FUNCTIONS IN: 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase activity; INVOLVED IN: response to light stimulus, isopentenyl diphosphate biosynthetic process, mevalonate-independent pathway; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast stroma, plastid; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase (InterPro:IPR001228), 4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase, conserved site (InterPro:IPR018294); Has 6821 Blast hits to 6815 proteins in 2244 species: Archae - 30; Bacteria - 4964; Metazoa - 52; Fungi - 6; Plants - 61; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1708 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:671054..673124 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33939.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 302 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMLQTNLGF ITSPTFLCPK LKVKLNSYLW FSYRSQVQKL DFSKRVNRSY KRDALLLSIK CSSSTGFDNS NVVVKEKSVS VILLAGGQGK RMKMSMPKQY 101: IPLLGQPIAL YSFFTFSRMP EVKEIVVVCD PFFRDIFEEY EESIDVDLRF AIPGKERQDS VYSGLQEIDV NSELVCIHDS ARPLVNTEDV EKVLKDGSAV 201: GAAVLGVPAK ATIKEVNSDS LVVKTLDRKT LWEMQTPQVI KPELLKKGFE LVKSEGLEVT DDVSIVEYLK HPVYVSQGSY TNIKVTTPDD LLLAERILSE 301: DS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)