AT2G01450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.922 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MAP kinase 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of MAP Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MAP kinase 17 (MPK17); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: MAP kinase, conserved site (InterPro:IPR003527), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MAP kinase 9 (TAIR:AT3G18040.1); Has 113085 Blast hits to 112072 proteins in 3455 species: Archae - 88; Bacteria - 12258; Metazoa - 41885; Fungi - 11781; Plants - 27798; Viruses - 485; Other Eukaryotes - 18790 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:199722..202010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55496.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 486 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLEKEFFTEY GEASQYQIQE VVGKGSYGVV ASAECPHTGG KVAIKKMTNV FEHVSDAIRI LREIKLLRLL RHPDIVEIKH IMLPPCRKEF KDIYVVFELM 101: ESDLHHVLKV NDDLTPQHHQ FFLYQLLRGL KFMHSAHVFH RDLKPKNILA NADCKIKICD LGLARVSFTD SPSAVFWTDY VATRWYRAPE LCGSFYSNYT 201: PAIDMWSVGC IFAEMLTGKP LFPGKNVVHQ LELVTDLLGT PSPITLSRIR NEKARKYLGN MRRKDPVPFT HKFPNIDPVA LKLLQRLIAF DPKDRPSAEE 301: ALADPYFQGL ANVDYEPSRQ PISKLEFEFE RRKLTRDDVR ELMYREILEY HPQMLQEYLQ GEENINSHFL YPSGVDQFKQ EFARLEEHND DEEEHNSPPH 401: QRKYTSLPRE RVCSSEDEGS DSVHAQSSSA SVVFTPPQTP NTATGLSSQK ASQVDKAATP VKRSACLMRS DSICASRCVG VSSAVS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)