AT2G01350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : quinolinate phoshoribosyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
At2g01350 encodes quinolinate phosphoribosyl transferase involved in NAD biosynthesis as shown by heterologous expression in E. coli. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
quinolinate phoshoribosyltransferase (QPT); FUNCTIONS IN: nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating) activity; INVOLVED IN: NAD biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (InterPro:IPR004393), Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal (InterPro:IPR022412), Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain (InterPro:IPR002638); Has 5853 Blast hits to 5853 proteins in 1914 species: Archae - 184; Bacteria - 3582; Metazoa - 59; Fungi - 129; Plants - 57; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1842 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:165332..167209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37957.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 348 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MISVSRFLSP QFYAIPRSFV KMSASATQTA GEVSMGIKPP SHPTYDLKAV IKLALAEDAG HTGDVTCMAT IPFDMEVEAY FLAKEDGIVA GVALADMIFE 101: HVDPSLKVEW MRKDGDYVHK GLKFGKVSGN AHKIVVAERV LLNFMQRMSG IATLTKLMAD AASPACILET RKTAPGLRLV DKWAVLIGGG RNHRMGLFDM 201: VMIKDNHISA AGGIVNAVKS VDEYLKQKNL EMDVEVETRT LEEVKEVLEY ASGSETRLTR IMLDNMVVPL ENGDVDVTML KDAVELINGR FETEASGNVT 301: LETVHKIGQS GVTFISSGAL THSVKALDIS LKIDTELALE VGRRTKRA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)