AT1G80640.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT2G25220.1); Has 94022 Blast hits to 93095 proteins in 3443 species: Archae - 76; Bacteria - 9181; Metazoa - 34848; Fungi - 7011; Plants - 29890; Viruses - 292; Other Eukaryotes - 12724 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:30311979..30314238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47375.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 427 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MCLLRHLLPI WVLLGFFFFS TATKSQESSV VYVSGASPEI PISQASPRMG AQSPGPPIVK VVLRQDLNKK ILIALIVSSS LLCVTVMFLV YLLLWRYRNM 101: KNSFTGIKRK SDSVKSVTTK PTVHKIDSVR KGTIPVYEYQ LLESATNKFS DSNVLSRGGR GCLYRACLDE KSSVTVKKLD GGGETDIEKQ FETEVDWLAK 201: IRHQNIVSLL GFCVYRQTSC IVYELMQNGS LESQLHGPSQ GSGLTWQLRM KIAVDIARGL EYLHEHCHPP VVHRDLKSSS ILLDSDFNAK ISDFGFATVL 301: TTQNKNLIHK ASEDLLDGKV TDKNDVYSFG VILLELLLGK KSVEKPSSEP ESIVTWAVPK LSDRANLPNI LDPAIKGTMD LKHLYQVAAV AVLCVQPEPS 401: YRPLITDVLH SLIPLLPVEL GGSLRIL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)