AT1G80310.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : sulfate transmembrane transporters | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
sulfate transmembrane transporters; FUNCTIONS IN: sulfate transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: response to salt stress; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulphate transporter (InterPro:IPR011547); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: molybdate transporter 1 (TAIR:AT2G25680.1); Has 846 Blast hits to 836 proteins in 367 species: Archae - 24; Bacteria - 581; Metazoa - 20; Fungi - 62; Plants - 71; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 88 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr1:+:30194951..30196345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 49554.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 8.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | 0.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 464 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: METTTTPLLP GDRSRCGWLR RRLRLKNPLS SELSGAVGDL GTFIPIVLTL TLVSNLDLST TLIFTGFYNI ATGLLFDIPM PVQPMKSIAA VAVSESPHLT 101: PSQIAAAGAS TAATLLLLGA TGAMSFLYNI IPLPVVRGVQ LSQGLQFAFT AIKYVRFNYD TATLKPSSSP RIWLGLDGLI LALAALLFII LSTGSGNDRE 201: AEDGDLAETS SNESQSRRRR LRLLSSIPSA LIVFALGLVL CFIRDPSIFK DLKFGPSKFH ILRISWDDWK IGFLRAAIPQ IPLSVLNSVI AVCKLSNDLF 301: DKELSATTVS ISVGVMNLIG CWFGAMPVCH GAGGLAGQYR FGARSGLSVI FLGIGKLIVG LVFGNSFVRI LSQFPIGILG VLLLFAGIEL AMASKDMNSK 401: EDSFIMLVCA AVSMTGSSAA LGFGCGVVLY LLLKLRTLDC SSVTLFSRSS DESQVDSEAA PRDV |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)