AT1G79680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.963 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WALL ASSOCIATED KINASE (WAK)-LIKE 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
WALL ASSOCIATED KINASE (WAK)-LIKE 10 (WAKL10); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system, integral to membrane; EXPRESSED IN: 10 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Wall-associated kinase (InterPro:IPR013695), EGF-like calcium-binding, conserved site (InterPro:IPR018097), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Wall-associated kinase family protein (TAIR:AT1G69730.1); Has 121485 Blast hits to 119425 proteins in 4418 species: Archae - 113; Bacteria - 13558; Metazoa - 45589; Fungi - 10331; Plants - 33597; Viruses - 488; Other Eukaryotes - 17809 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:29980188..29982749 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 85708.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 769 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSNCSCSLL SLFSLLLIID LTVASSCPKT CGGIDIPYPF GIGTGCYLEK WYEIICVNNS VPFLSIINRE VVSISFSDMY RRFFNVGYGS IRIRNPIASK 101: GCSSGGQEFG SLLNMTGYPF YLGDNNMLIA VGCNNTASLT NVEPSIVGCE STCSTNQDIP INDYLGVLYC NARYGDSEYC KNISIMNDTS CNGIGCCKAS 201: LPARYQQIIG VEIDDSNTES KGCKVAFITD EEYFLSNGSD PERLHANGYD TVDLRWFIHT ANHSFIGSLG CKSIDEYTIL RRDNREYGIG CLCDYNSTTT 301: GYATCSCASG FEGNPYIPGE CKDINECVRG IDGNPVCTAG KCVNLLGGYT CEYTNHRPLV IGLSTSFSTL VFIGGIYWLY KFIRRQRRLN QKKKFFKRNG 401: GLLLQQQLTT TEGNVDSTRV FNSRELEKAT ENFSLTRILG EGGQGTVYKG MLVDGRIVAV KKSKVVDEDK LEEFINEVVI LSQINHRNIV KLLGCCLETD 501: VPILVYEFIP NGNLFEHLHD DSDDYTMTTW EVRLRIAVDI AGALSYLHSA ASSPIYHRDI KSTNIMLDEK HRAKVSDFGT SRTVTVDHTH LTTVVSGTVG 601: YMDPEYFQSS QFTDKSDVYS FGVVLAELIT GEKSVSFLRS QEYRTLATYF TLAMKENRLS DIIDARIRDG CKLNQVTAAA KIARKCLNMK GRKRPSMRQV 701: SMELEKIRSY SEDMQPYEYA SENEEEKKET LVDVNVESRN YVSVTAASSQ YSIATTSSSR SDVEPLFPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)