AT1G78970.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : lupeol synthase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Lupeol synthase. Converts oxidosqualene to multiple triterpene alcohols and a triterpene diols. This conversion proceeds through the formation of a 17β-dammarenyl cation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
lupeol synthase 1 (LUP1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Terpene synthase, conserved site (InterPro:IPR002365), Terpenoid cylases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid (InterPro:IPR008930), Squalene cyclase (InterPro:IPR018333), Prenyltransferase/squalene oxidase (InterPro:IPR001330); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: lupeol synthase 2 (TAIR:AT1G78960.1); Has 2106 Blast hits to 1984 proteins in 578 species: Archae - 2; Bacteria - 957; Metazoa - 82; Fungi - 241; Plants - 614; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 210 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29703414..29707715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 87356.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 757 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWKLKIGKGN GEDPHLFSSN NFVGRQTWKF DHKAGSPEER AAVEEARRGF LDNRFRVKGC SDLLWRMQFL REKKFEQGIP QLKATNIEEI TYETTTNALR 101: RGVRYFTALQ ASDGHWPGEI TGPLFFLPPL IFCLYITGHL EEVFDAEHRK EMLRHIYCHQ NEDGGWGLHI ESKSVMFCTV LNYICLRMLG ENPEQDACKR 201: ARQWILDRGG VIFIPSWGKF WLSILGVYDW SGTNPTPPEL LMLPSFLPIH PGKILCYSRM VSIPMSYLYG KRFVGPITPL ILLLREELYL EPYEEINWKK 301: SRRLYAKEDM YYAHPLVQDL LSDTLQNFVE PLLTRWPLNK LVREKALQLT MKHIHYEDEN SHYITIGCVE KVLCMLACWV ENPNGDYFKK HLARIPDYMW 401: VAEDGMKMQS FGCQLWDTGF AIQALLASNL PDETDDALKR GHNYIKASQV RENPSGDFRS MYRHISKGAW TFSDRDHGWQ VSDCTAEALK CCLLLSMMSA 501: DIVGQKIDDE QLYDSVNLLL SLQSGNGGVN AWEPSRAYKW LELLNPTEFM ANTMVEREFV ECTSSVIQAL DLFRKLYPDH RKKEINRSIE KAVQFIQDNQ 601: TPDGSWYGNW GVCFIYATWF ALGGLAAAGE TYNDCLAMRN GVHFLLTTQR DDGGWGESYL SCSEQRYIPS EGERSNLVQT SWAMMALIHT GQAERDLIPL 701: HRAAKLIINS QLENGDFPQQ EIVGAFMNTC MLHYATYRNT FPLWALAEYR KVVFIVN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)