AT1G78670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.971 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : gamma-glutamyl hydrolase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
gamma-glutamyl hydrolase 3 (GGH3); FUNCTIONS IN: hydrolase activity, omega peptidase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: glutamine metabolic process; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase C26, gamma-glutamyl hydrolase (InterPro:IPR015527), Peptidase C26 (InterPro:IPR011697); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: gamma-glutamyl hydrolase 2 (TAIR:AT1G78680.1); Has 364 Blast hits to 360 proteins in 88 species: Archae - 0; Bacteria - 9; Metazoa - 192; Fungi - 0; Plants - 79; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 84 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29591053..29593319 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39884.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 352 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWRFCFFLSL LFFDVSAVKS AESIFLPSQI GVEDSRVFES LSLSPVCSAA DPNLNYKPVI GILTHPGEGR WDARLHSLKN YAYATNISYI AASYVKLAET 101: GGARVIPLIY NEPEEILFQK LELVNGVIFT GGWAKTGLYY DVVEKIFNKV MEKNDAGEHF PVYAMCLGFE ILSMIISQNR DILERFNSVN YASSLQFFKN 201: VNIEATVFQR FPPELLKKLS ADCLVMQNHY FGISPDNFQG NPYLSSFFNI VTTSADKDSK TFVSTIRSKR YPVTAFQWHP EKNAFEWGSS EIPHSEDAIQ 301: VTQHAANYLV SEARKSMNRP SSEKVLSNLI YNYKPTYSGY KGSGDDEVYI FT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)