AT1G78300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : general regulatory factor 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
G-box binding factor GF14 omega encoding a 14-3-3 protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
general regulatory factor 2 (GRF2); FUNCTIONS IN: protein phosphorylated amino acid binding; INVOLVED IN: brassinosteroid mediated signaling pathway; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 17 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 14-3-3 protein (InterPro:IPR000308); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GF14 protein phi chain (TAIR:AT1G35160.1); Has 2698 Blast hits to 2688 proteins in 383 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1259; Fungi - 318; Plants - 766; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 355 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29461883..29463052 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29163.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 259 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASGREEFVY MAKLAEQAER YEEMVEFMEK VSAAVDGDEL TVEERNLLSV AYKNVIGARR ASWRIISSIE QKEESRGNDD HVTAIREYRS KIETELSGIC 101: DGILKLLDSR LIPAAASGDS KVFYLKMKGD YHRYLAEFKT GQERKDAAEH TLAAYKSAQD IANAELAPTH PIRLGLALNF SVFYYEILNS PDRACNLAKQ 201: AFDEAIAELD TLGEESYKDS TLIMQLLRDN LTLWTSDMQD DAADEIKEAA APKPTEEQQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)