AT1G77540.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 ASURE: peroxisome What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a H3/H4 histone acetyltransferase. Belongs to the GNAT family, whose many members are involved in histone acetylation and chromatin remodeling, and are important for the regulation of cell growth and development. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acyl-CoA N-acyltransferase (InterPro:IPR016181); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein (TAIR:AT1G21770.1); Has 329 Blast hits to 329 proteins in 159 species: Archae - 6; Bacteria - 264; Metazoa - 8; Fungi - 0; Plants - 43; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 8 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:29137762..29138182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12855.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 114 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTNTAATTEA KMATEPPKIV WNEGKRRFET EDHEAFIEYK MRNNGKVMDL VHTYVPSFKR GLGLASHLCV AAFEHASSHS ISIIPSCSYV SDTFLPRNPS 101: WKPLIHSEVF KSSI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)