AT1G77490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : thylakoidal ascorbate peroxidase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a chloroplastic thylakoid ascorbate peroxidase tAPX. Ascorbate peroxidases are enzymes that scavenge hydrogen peroxide in plant cells. Eight types of APX have been described for Arabidopsis: three cytosolic (APX1, APX2, APX6), two chloroplastic types (stromal sAPX, thylakoid tAPX), and three microsomal (APX3, APX4, APX5) isoforms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
thylakoidal ascorbate peroxidase (TAPX); FUNCTIONS IN: L-ascorbate peroxidase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, response to oxidative stress; LOCATED IN: thylakoid, chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Plant ascorbate peroxidase (InterPro:IPR002207), Peroxidases heam-ligand binding site (InterPro:IPR019793), Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial (InterPro:IPR002016); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: stromal ascorbate peroxidase (TAIR:AT4G08390.2); Has 7809 Blast hits to 7730 proteins in 1256 species: Archae - 55; Bacteria - 2313; Metazoa - 5; Fungi - 620; Plants - 3345; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1471 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29117688..29120046 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46094.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 426 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSVSLSAASH LLCSSTRVSL SPAVTSSSSS PVVALSSSTS PHSLGSVASS SLFPHSSFVL QKKHPINGTS TRMISPKCAA SDAAQLISAK EDIKVLLRTK 101: FCHPILVRLG WHDAGTYNKN IEEWPLRGGA NGSLRFEAEL KHAANAGLLN ALKLIQPLKD KYPNISYADL FQLASATAIE EAGGPDIPMK YGRVDVVAPE 201: QCPEEGRLPD AGPPSPADHL RDVFYRMGLD DKEIVALSGA HTLGRARPDR SGWGKPETKY TKTGPGEAGG QSWTVKWLKF DNSYFKDIKE KRDDDLLVLP 301: TDAALFEDPS FKNYAEKYAE DVAAFFKDYA EAHAKLSNLG AKFDPPEGIV IENVPEKFVA AKYSTGKKEL SDSMKKKIRA EYEAIGGSPD KPLPTNYFLN 401: IIIAIGVLVL LSTLFGGNNN SDFSGF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)