AT1G76770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.511 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : HSP20-like chaperones superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
HSP20-like chaperones superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Heat shock protein Hsp20 (InterPro:IPR002068), HSP20-like chaperone (InterPro:IPR008978); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HSP20-like chaperones superfamily protein (TAIR:AT1G76780.1); Has 34199 Blast hits to 13978 proteins in 906 species: Archae - 121; Bacteria - 2729; Metazoa - 11362; Fungi - 2329; Plants - 1617; Viruses - 809; Other Eukaryotes - 15232 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:28813569..28814378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28694.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 244 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELELGLKIT RTKDDVSSST DFRVARDSFG HRSLSRETNS VFFLILHLKG FKKDGIDIEI NKEGNLIKIS GRKQVEEMVL VKWVEWKKET EIKEFKKVFR 101: IPDIVILDKI KARFNEEDGT LTVTMPKKVK GITGLKIEEE DEEEEMKEPI VEEKTEEKTE PEEEIKEETK PEEENEEAEE PQREEEEEVV EEGTRDHEGK 201: KEEEIEDKPR KKRRKKFRLP CFAGSTLLMS IIVFIIQLIQ SRNK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)